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李路论文集
Collected Papers by Li Lu
3 DNA 载体的数据分类及查询系统的应用
DNA 载体是基因工程中重要的研究工具,无论是在研究上还是在应用上,
越来越多的实验室和生物公司都相继开发出各种各样的载体,以适应不断发展的
基因工程学科的需要。自 1977 年 Bolivar 等组建了第一个系列的克隆载体 pBR
以来,已建立起的各种分子克隆载体用于不同的科学研究和生物种类。
按照克隆载体的功能或用途来划分,可将 DNA 载体分为两大类:
(1)普通型载体(vector):这类载体主要用于各种基因组文库和 cDNA 文
库的建立,如常用的 pBR322,由 λ 衍生的载体和 COS 质粒,以及一些大肠杆菌-
酿酒酵母穿梭载体,如 YRp7 和 YEp13 等。染色体 DNA 片段或 cDNA 均可用这
类载体进行增殖。它们通常含有两个或两个以上的标记基因,其中一个基因用于
选择转化体(transformant),另一基因则是用于检查载体中是否有外源 DNA 插入。
(2)表达型载体(expression vector):这类载体主要用于研究基因的表达
或是用于大量生产某些转录产物或蛋白质,有的也可用于 cDNA 文库的建立。
这类载体除具有普通型载体的特征外,还含有某些基因的启动子序列,有的
还含有转录终止子序列。为了基因表达产物便于检测或是简化基因表达产物的分
离纯化,有的表达型载体除含有基因启动子序列外,还有一段为信号肽链编码的
DNA 序列,这段信号肽链可以使蛋白质分泌到细胞外。这类载体又可称为分泌
表达型载体(secretion expression vector)。为了使某些基因产物能投入到大规模
的工业生产中,科学家们已组建了各种高效表达的分泌型载体。
在载体的实际应用中,由于相同的载体种类里有不同的载体可以选择,如何
寻找一个合适的载体即成为研究人员需要认真考虑的问题。DNA 载体的数据分
类及查询系统可以帮助研究人员快速地搜索到理想的载体,既节约时间,又提高
了使用载体的正确性,避免了不必要的重复工作。
在检索 DNA 载体的数据分类及查询系统时,只需要设置几个关键词,如载
体的类型、载体的启动子、标记基因,以及需要用到的限制性内切酶等,设置
的关键词越多,搜索的范围就越小,有利于快速搜以大肠杆菌超氧化物歧化酶
(superoxide dis-mutase,SOD)基因的克隆和表达为例,如果让 SOD 基因能够
在大肠杆菌里表达,首先要把体外扩增得到的 SOD 基因克隆到一个有多酶切位
点的载体里,才能够将该基因用适当的酶切割下来,再克隆到能够在大肠杆菌
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