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动物生物技术与繁殖研究
Research on Animal Biotechnology and Reproduction

5- 甲基胞嘧啶向 5- 羟甲基胞嘧啶转变，表明在 SCNT 胚胎中也发生了主动去甲
基化。
过去的一项研究发现小鼠SCNT胚胎直到4细胞阶段依然维持高甲基化水平，
与供体卵丘细胞相似，表明 SCNT 胚胎全局去甲基化可能需要经历好几轮 DNA

复制。最近的一项研究使用全基因组重亚硫酸盐测序技术，揭示了小鼠 SCNT 囊
胚期胚胎的 DNA 甲基化图谱，发现其与 IVF 胚胎类似，都处于一个低甲基化水平。
鉴于 DNA 复制依赖性稀释是小鼠 IVF 胚胎移植前发育过程中 DNA 去甲基化的

主要驱动力，以上结果表明小鼠 SCNT 胚胎中同样使用 DNA 复制依赖性去甲基
化机制，在其他哺乳动物中可能也是如此。有趣的是，在斑马鱼中，父源基因组
在受精后始终保持高甲基化水平，而母源基因组甲基化水平持续升高直到同样达
到高甲基化水平，表明不同物种受精后胚胎的 DNA 甲基化重编程方式有所不同。

（四）染色质结构重编程
核小体在基因组上的定位由染色质重塑因子动态调节，并且在限制 DNA
可及性上起重要作用，因此，核小体定位和相关联的染色质可及性改变被认为
是 SCNT 中体细胞向全能性细胞转变的一种全局重编程。近期研究人员使用

liDNase-seq 分析了小鼠 SCNT 胚胎 1 细胞期和供体卵丘细胞的染色质可及性图
谱，揭示出 SCNT 胚胎被激活后 12h 以内供体细胞的全局染色质可及性经历了快
速的重编程，转变为体外受精来源的合子模式。尽管全局染色质可及性被重编程，
但与 IVF 胚胎的染色质结构重编程相比，仍有一些区域对于重编程具有抵抗性，

其染色质可及性没有转变为全能性状态。
在供体体细胞和 SCNT2 细胞期胚胎中，这些区域富集了异染色质标记
H3K9me3，而 H3K9me3 也被认为是表观重编程的一个阻碍。还有研究团队使用
经过优化的少量细胞全基因组染色质构象捕获技术，对小鼠 SCNT 胚胎发育过程

进行连续采样，并详细描绘了 SCNT 植入前胚胎染色质高级结构的动态变化过程，
与正常受精胚胎数据进行比较分析后发现，SCNT 胚胎在 2 细胞期的远距离相互
作用较正常受精胚胎明显降低。同时，早期受精胚胎与 SCNT 胚胎的区室结构及
拓扑相关结构域也存在着明显的差异。研究人员证实这是由于供体细胞基因组中

持续存在的组蛋白 H3K9me3 修饰无法被正常擦除造成的。在 SCNT 胚胎中过表
达组蛋白去甲基化酶 Kdm4d 来降低 H3K9me3 修饰水平，SCNT 胚胎的染色质空
间构象会趋向正常受精胚胎，这也说明 H3K9me3 修饰是核移植胚胎中染色质高

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